TY - JOUR AU - Hanahan, D. AU - Weinberg, R. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - The Hallmarks of Cancer JO - Cell VL - 100 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(00)81683-9 DO - 10.1016/S0092-8674(00)81683-9 ID - Hanahan2000 ER - TY - JOUR AU - Agrawal, D. AU - Chen, T. AU - Irby, R. AU - Quackenbush, J. AU - Chambers, A. F. AU - Szabo, M. AU - Cantor, A. AU - Coppola, D. AU - Yeatman, T. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Osteopontin identified as lead marker of colon cancer progression, using pooled sample expression profiling JO - J Natl Cancer Inst VL - 94 UR - https://doi.org/10.1093/jnci/94.7.513 DO - 10.1093/jnci/94.7.513 ID - Agrawal2002 ER - TY - JOUR AU - Eschrich, S. AU - Yang, I. AU - Bloom, G. AU - Kwong, K. Y. AU - Boulware, D. AU - Cantor, A. AU - Coppola, D. AU - Kruhoffer, M. AU - Aaltonen, L. AU - Orntoft, T. F. PY - 2005 DA - 2005// TI - Molecular staging for survival prediction of colorectal cancer patients JO - J Clin Oncol VL - 23 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2005.00.695 DO - 10.1200/JCO.2005.00.695 ID - Eschrich2005 ER - TY - JOUR AU - Jorissen, R. N. AU - Gibbs, P. AU - Christie, M. AU - Prakash, S. AU - Lipton, L. AU - Desai, J. AU - Kerr, D. AU - Aaltonen, L. A. AU - Arango, D. AU - Kruhoffer, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Metastasis-Associated Gene Expression Changes Predict Poor Outcomes in Patients with Dukes Stage B and C Colorectal Cancer JO - Clin Cancer Res VL - 15 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-09-1431 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-09-1431 ID - Jorissen2009 ER - TY - JOUR AU - Smith, J. J. AU - Deane, N. G. AU - Wu, F. AU - Merchant, N. B. AU - Zhang, B. AU - Jiang, A. AU - Lu, P. AU - Johnson, J. C. AU - Schmidt, C. AU - Bailey, C. E. PY - 2010 DA - 2010// TI - Experimentally derived metastasis gene expression profile predicts recurrence and death in patients with colon cancer JO - Gastroenterology VL - 138 UR - https://doi.org/10.1053/j.gastro.2009.11.005 DO - 10.1053/j.gastro.2009.11.005 ID - Smith2010 ER - TY - JOUR AU - Wang, Y. AU - Jatkoe, T. AU - Zhang, Y. AU - Mutch, M. G. AU - Talantov, D. AU - Jiang, J. AU - McLeod, H. L. AU - Atkins, D. PY - 2004 DA - 2004// TI - Gene expression profiles and molecular markers to predict recurrence of Dukes' B colon cancer JO - J Clin Oncol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2004.08.186 DO - 10.1200/JCO.2004.08.186 ID - Wang2004 ER - TY - JOUR AU - Malvezzi, M. AU - Bertuccio, P. AU - Chatenoud, L. AU - Negri, E. AU - La Vecchia, C. AU - Decarli, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Cancer mortality in Italy, 2003 JO - Tumori VL - 95 ID - Malvezzi2009 ER - TY - JOUR AU - Bertucci, F. AU - Finetti, P. AU - Cervera, N. AU - Charafe-Jauffret, E. AU - Mamessier, E. AU - Adelaide, J. AU - Debono, S. AU - Houvenaeghel, G. AU - Maraninchi, D. AU - Viens, P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Gene expression profiling shows medullary breast cancer is a subgroup of basal breast cancers JO - Cancer Res VL - 66 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-06-0031 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-06-0031 ID - Bertucci2006 ER - TY - JOUR AU - Bertucci, F. AU - Finetti, P. AU - Rougemont, J. AU - Charafe-Jauffret, E. AU - Cervera, N. AU - Tarpin, C. AU - Nguyen, C. AU - Xerri, L. AU - Houlgatte, R. AU - Jacquemier, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene expression profiling identifies molecular subtypes of inflammatory breast cancer JO - Cancer Res VL - 65 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-04-4115 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-04-4115 ID - Bertucci2005 ER - TY - JOUR AU - Bertucci, F. AU - Orsetti, B. AU - Negre, V. AU - Finetti, P. AU - Rouge, C. AU - Ahomadegbe, J. C. AU - Bibeau, F. AU - Mathieu, M. C. AU - Treilleux, I. AU - Jacquemier, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Lobular and ductal carcinomas of the breast have distinct genomic and expression profiles JO - Oncogene VL - 27 UR - https://doi.org/10.1038/onc.2008.158 DO - 10.1038/onc.2008.158 ID - Bertucci2008 ER - TY - JOUR AU - Desmedt, C. AU - Haibe-Kains, B. AU - Wirapati, P. AU - Buyse, M. AU - Larsimont, D. AU - Bontempi, G. AU - Delorenzi, M. AU - Piccart, M. AU - Sotiriou, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Biological processes associated with breast cancer clinical outcome depend on the molecular subtypes JO - Clin Cancer Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-07-4756 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-07-4756 ID - Desmedt2008 ER - TY - JOUR AU - Desmedt, C. AU - Piette, F. AU - Loi, S. AU - Wang, Y. AU - Lallemand, F. AU - Haibe-Kains, B. AU - Viale, G. AU - Delorenzi, M. AU - Zhang, Y. AU - d'Assignies, M. S. PY - 2007 DA - 2007// TI - Strong time dependence of the 76-gene prognostic signature for node-negative breast cancer patients in the TRANSBIG multicenter independent validation series JO - Clin Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-06-2765 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-06-2765 ID - Desmedt2007 ER - TY - JOUR AU - Dressman, H. K. AU - Hans, C. AU - Bild, A. AU - Olson, J. A. AU - Rosen, E. AU - Marcom, P. K. AU - Liotcheva, V. B. AU - Jones, E. L. AU - Vujaskovic, Z. AU - Marks, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Gene expression profiles of multiple breast cancer phenotypes and response to neoadjuvant chemotherapy JO - Clin Cancer Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-05-1447 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-05-1447 ID - Dressman2006 ER - TY - JOUR AU - Dyrskjot, L. AU - Zieger, K. AU - Real, F. X. AU - Malats, N. AU - Carrato, A. AU - Hurst, C. AU - Kotwal, S. AU - Knowles, M. AU - Malmstrom, P. U. AU - de la Torre, M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Gene expression signatures predict outcome in non-muscle-invasive bladder carcinoma: a multicenter validation study JO - Clin Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-06-2940 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-06-2940 ID - Dyrskjot2007 ER - TY - JOUR AU - Rosser, C. J. AU - Liu, L. AU - Sun, Y. AU - Villicana, P. AU - McCullers, M. AU - Porvasnik, S. AU - Young, P. R. AU - Parker, A. S. AU - Goodison, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Bladder cancer-associated gene expression signatures identified by profiling of exfoliated urothelia JO - Cancer Epidemiol Biomarkers Prev VL - 18 UR - https://doi.org/10.1158/1055-9965.EPI-08-1002 DO - 10.1158/1055-9965.EPI-08-1002 ID - Rosser2009 ER - TY - JOUR AU - Bild, A. H. AU - Yao, G. AU - Chang, J. T. AU - Wang, Q. AU - Potti, A. AU - Chasse, D. AU - Joshi, M. B. AU - Harpole, D. AU - Lancaster, J. M. AU - Berchuck, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Oncogenic pathway signatures in human cancers as a guide to targeted therapies JO - Nature VL - 439 UR - https://doi.org/10.1038/nature04296 DO - 10.1038/nature04296 ID - Bild2006 ER - TY - JOUR AU - Huang, E. AU - Ishida, S. AU - Pittman, J. AU - Dressman, H. AU - Bild, A. AU - Kloos, M. AU - D'Amico, M. AU - Pestell, R. G. AU - West, M. AU - Nevins, J. R. PY - 2003 DA - 2003// TI - Gene expression phenotypic models that predict the activity of oncogenic pathways JO - Nat Genet VL - 34 UR - https://doi.org/10.1038/ng1167 DO - 10.1038/ng1167 ID - Huang2003 ER - TY - STD TI - Loboda A, Nebozhyn M, Klinghoffer R, Frazier J, Chastain M, Arthur W, Roberts B, Zhang T, Chenard M, Haines B, et al: A gene expression signature of RAS pathway dependence predicts response to PI3K and RAS pathway inhibitors and expands the population of RAS pathway activated tumors. BMC Med Genomics. 3: 26-10.1186/1755-8794-3-26. ID - ref18 ER - TY - JOUR AU - Singh, A. AU - Greninger, P. AU - Rhodes, D. AU - Koopman, L. AU - Violette, S. AU - Bardeesy, N. AU - Settleman, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - A gene expression signature associated with "K-Ras addiction" reveals regulators of EMT and tumor cell survival JO - Cancer Cell VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/j.ccr.2009.03.022 DO - 10.1016/j.ccr.2009.03.022 ID - Singh2009 ER - TY - JOUR AU - Gumireddy, K. AU - Li, A. AU - Gimotty, P. A. AU - Klein-Szanto, A. J. AU - Showe, L. C. AU - Katsaros, D. AU - Coukos, G. AU - Zhang, L. AU - Huang, Q. PY - 2009 DA - 2009// TI - KLF17 is a negative regulator of epithelial-mesenchymal transition and metastasis in breast cancer JO - Nat Cell Biol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/ncb1974 DO - 10.1038/ncb1974 ID - Gumireddy2009 ER - TY - JOUR AU - Lin, Y. H. AU - Friederichs, J. AU - Black, M. A. AU - Mages, J. AU - Rosenberg, R. AU - Guilford, P. J. AU - Phillips, V. AU - Thompson-Fawcett, M. AU - Kasabov, N. AU - Toro, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Multiple gene expression classifiers from different array platforms predict poor prognosis of colorectal cancer JO - Clin Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-05-2734 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-05-2734 ID - Lin2007 ER - TY - JOUR AU - Kruhoffer, M. AU - Jensen, J. L. AU - Laiho, P. AU - Dyrskjot, L. AU - Salovaara, R. AU - Arango, D. AU - Birkenkamp-Demtroder, K. AU - Sorensen, F. B. AU - Christensen, L. L. AU - Buhl, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene expression signatures for colorectal cancer microsatellite status and HNPCC JO - Br J Cancer VL - 92 UR - https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6602621 DO - 10.1038/sj.bjc.6602621 ID - Kruhoffer2005 ER - TY - JOUR AU - Enriquez, J. M. AU - Diez, M. AU - Tobaruela, E. AU - Lozano, O. AU - Dominguez, P. AU - Gonzalez, A. AU - Muguerza, J. M. AU - Ratia, T. PY - 1998 DA - 1998// TI - Clinical, histopathological, cytogenetic and prognostic differences between mucinous and nonmucinous colorectal adenocarcinomas JO - Rev Esp Enferm Dig VL - 90 ID - Enriquez1998 ER - TY - JOUR AU - Mojica, W. AU - Hawthorn, L. PY - 2010 DA - 2010// TI - Normal colon epithelium: a dataset for the analysis of gene expression and alternative splicing events in colon disease JO - BMC Genomics VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-5 DO - 10.1186/1471-2164-11-5 ID - Mojica2010 ER - TY - JOUR AU - Reid, J. F. AU - Gariboldi, M. AU - Sokolova, V. AU - Capobianco, P. AU - Lampis, A. AU - Perrone, F. AU - Signoroni, S. AU - Costa, A. AU - Leo, E. AU - Pilotti, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Integrative approach for prioritizing cancer genes in sporadic colon cancer JO - Genes Chromosomes Cancer VL - 48 UR - https://doi.org/10.1002/gcc.20697 DO - 10.1002/gcc.20697 ID - Reid2009 ER - TY - JOUR AU - Gregory, P. A. AU - Bert, A. G. AU - Paterson, E. L. AU - Barry, S. C. AU - Tsykin, A. AU - Farshid, G. AU - Vadas, M. A. AU - Khew-Goodall, Y. AU - Goodall, G. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - The miR-200 family and miR-205 regulate epithelial to mesenchymal transition by targeting ZEB1 and SIP1 JO - Nat Cell Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1038/ncb1722 DO - 10.1038/ncb1722 ID - Gregory2008 ER - TY - JOUR AU - Park, S. M. AU - Gaur, A. B. AU - Lengyel, E. AU - Peter, M. E. PY - 2008 DA - 2008// TI - The miR-200 family determines the epithelial phenotype of cancer cells by targeting the E-cadherin repressors ZEB1 and ZEB2 JO - Genes Dev VL - 22 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1640608 DO - 10.1101/gad.1640608 ID - Park2008 ER - TY - JOUR AU - Pino, M. S. AU - Kikuchi, H. AU - Zeng, M. AU - Herraiz, M. T. AU - Sperduti, I. AU - Berger, D. AU - Park, D. Y. AU - Iafrate, A. J. AU - Zukerberg, L. R. AU - Chung, D. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Epithelial to mesenchymal transition is impaired in colon cancer cells with microsatellite instability JO - Gastroenterology VL - 138 UR - https://doi.org/10.1053/j.gastro.2009.12.010 DO - 10.1053/j.gastro.2009.12.010 ID - Pino2010 ER - TY - JOUR AU - Ganepola, G. A. AU - Mazziotta, R. M. AU - Weeresinghe, D. AU - Corner, G. A. AU - Parish, C. J. AU - Chang, D. H. AU - Tebbutt, N. C. AU - Murone, C. AU - Ahmed, N. AU - Augenlicht, L. H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Gene expression profiling of primary and metastatic colon cancers identifies a reduced proliferative rate in metastatic tumors JO - Clinical & experimental metastasis VL - 27 UR - https://doi.org/10.1007/s10585-009-9295-2 DO - 10.1007/s10585-009-9295-2 ID - Ganepola2010 ER - TY - JOUR AU - Vincan, E. AU - Barker, N. PY - 2008 DA - 2008// TI - The upstream components of the Wnt signalling pathway in the dynamic EMT and MET associated with colorectal cancer progression JO - Clinical & experimental metastasis VL - 25 UR - https://doi.org/10.1007/s10585-008-9156-4 DO - 10.1007/s10585-008-9156-4 ID - Vincan2008 ER - TY - JOUR AU - Edwards, B. K. AU - Ward, E. AU - Kohler, B. A. AU - Eheman, C. AU - Zauber, A. G. AU - Anderson, R. N. AU - Jemal, A. AU - Schymura, M. J. AU - Lansdorp-Vogelaar, I. AU - Seeff, L. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Annual report to the nation on the status of cancer, 1975-2006 featuring colorectal cancer trends and impact of interventions (risk factors, screening, and treatment) to reduce future rates JO - Cancer VL - 116 UR - https://doi.org/10.1002/cncr.24760 DO - 10.1002/cncr.24760 ID - Edwards2010 ER - TY - STD TI - The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1755-8794/4/9/prepub UR - http://www.biomedcentral.com/1755-8794/4/9/prepub ID - ref32 ER -