Table 5 RNA degradation: whole-blood

RIN

9

7

6

2

0

Average Quality

36

36

36

36

35

Raw Reads

14.221591

15.528347

12.679709

14.225867

11.689436

Size (<15 nt)

3.78 %

4.92 %

3.99 %

3.54 %

6.23 %

Low Quality (Q <30)

2.82 %

2.96 %

3.00 %

2.63 %

3.42 %

Adapter-Adapter

1.11 %

0.47 %

0.38 %

0.85 %

3.35 %

RNAs >40 nt

25.56 %

21.41 %

28.98 %

23.04 %

15.47 %

Surviving Reads

66.73 %

70.24 %

63.67 %

69.95 %

71.53 %

Unmapped

3.26 %

4.30 %

3.53 %

2.81 %

3.40 %

Uniq-Mapped

7.78 %

8.83 %

6.82 %

7.98 %

7.74 %

Multi-Mapped

88.96 %

86.87 %

89.65 %

89.21 %

88.86 %

miRNA

91.57 %

87.64 %

92.01 %

93.66 %

89.99 %

Other ncRNAs

1.20 %

3.74 %

0.93 %

0.84 %

1.40 %

Repeat

2.52 %

2.57 %

2.29 %

1.64 %

3.25 %

Coding Gene

0.11 %

0.23 %

0.09 %

0.08 %

0.17 %

Unknown

1.35 %

1.53 %

1.15 %

0.97 %

1.79 %

miRNA Count (≥1)

469

463

399

476

488