Table 1 The comparison of transcriptomic biomarkers between fatal and nonfatal C-IRIS
Gene | Fatal C-IRIS group | C-IRIS survivor group, earlier arm | C-IRIS survivor group, deferred arm | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
Symbol | R for VIP | VIP rank | R for VIP | VIP rank | R for VIP | VIP rank |
LIMK1 | − 0.0116 | − − − − − | 0.0054 | + + + + | 0.015 | + + + + |
ALOX5 | − 0.0101 | − − − − | 0.0026 | + + | 0.0102 | + + + |
CTSC | − 0.0087 | − − − − | 0.0056 | + + + + | 0.0137 | + + + + |
IL17REL | − 0.0092 | − − − − | 0.0033 | + + | 0.0074 | + + |
TLR10 | − 0.0089 | − − − − | 0.0027 | + + | 0.012 | + + + |
C3AR1 | − 0.0086 | − − − | 0.0058 | + + + + | 0.012 | + + + |
CTSD | − 0.0064 | − − − | 0.0038 | + + + | 0.0054 | + + |
CTSK | − 0.0086 | − − − | 0.0045 | + + + | 0.0103 | + + + |
DEFB115 | − 0.007 | − − − | 0.0057 | + + + + | 0.0122 | + + + |
IL17D | − 0.0068 | − − − | 0.0036 | + + | 0.0111 | + + + |
ITGA7 | − 0.0077 | − − − | 0.0058 | + + + + | 0.0086 | + + |
ITGB2 | − 0.0067 | − − − | 0.0052 | + + + | 0.0086 | + + |
JAG1 | − 0.0085 | − − − | 0.0034 | + + | 0.011 | + + + |
SIGLEC10 | − 0.0074 | − − − | 0.0065 | + + + + | 0.0118 | + + + |
ALPL | − 0.0044 | − − | 0.0063 | + + + + | 0.0103 | + + + |
CASP5 | − 0.0042 | − − | 0.0045 | + + + | 0.0121 | + + + |
DEFA5 | − 0.0044 | − − | 0.0047 | + + + | 0.0047 | + |
ITGAX | − 0.0061 | − − | 0.0069 | + + + + + | 0.0106 | + + + |
NOD2 | − 0.0043 | − − | 0.0043 | + + + | 0.0054 | + + |
NOTCH2 | − 0.0045 | − − | 0.0048 | + + + | 0.0063 | + + |
NOX1 | − 0.004 | − − | 0.0048 | + + + | 0.0044 | + |
SIGLEC5 | − 0.0044 | − − | 0.0037 | + + + | 0.0084 | + + |
SIGLEC7 | − 0.0057 | − − | 0.0047 | + + + | 0.0091 | + + + |
BEX1 | − 0.0033 | − | 0.0027 | + + | 0.0026 | + |
CASP2 | − 0.0034 | − | 0.0038 | + + + | 0.0063 | + + |
ITGA5 | − 0.0034 | − | 0.0056 | + + + + | 0.0043 | + |
SIRPA | − 0.0018 | − | 0.0038 | + + + | 0.007 | + + |
IL1RAP | 0.0146 | + + + + + + | − 0.002 | − | − 0.0071 | − − |
MMP20 | 0.0117 | + + + + + | − 0.0037 | − − | − 0.0086 | − − |
ALOX5AP | 0.0087 | + + + + | − 0.0035 | − − | − 0.0073 | − − |
CCL1 | 0.0103 | + + + + | − 0.004 | − − − | − 0.0079 | − − |
CD55 | 0.0089 | + + + + | − 0.0005 | − 0.0041 | − | |
CLEC4D | 0.0102 | + + + + | − 0.0027 | − − | − 0.0055 | − − |
CLEC4E | 0.0106 | + + + + | − 0.0049 | − − − | − 0.0068 | − − |
CLEC5A | 0.0091 | + + + + | − 0.0032 | − − | − 0.004 | − |
F2RL2 | 0.0088 | + + + + | − 0.0011 | − | − 0.0058 | − − |
FADD | 0.0102 | + + + + | − 0.0037 | − − − | − 0.0071 | − − |
FAM65B | 0.0091 | + + + + | − 0.0006 | − | − 0.0029 | − |
IFNAR1 | 0.0094 | + + + + | − 0.0018 | − | − 0.0037 | − |
IL18R1 | 0.0106 | + + + + | − 0.0018 | − | − 0.0032 | − |
IL18RAP | 0.0101 | + + + + | − 0.0016 | − | − 0.0049 | − |
IL1R1 | 0.01 | + + + + | − 0.0019 | − | − 0.0052 | − |
IRAK3 | 0.0088 | + + + + | − 0.0007 | − | − 0.0042 | − |
KLKP1 | 0.0102 | + + + + | − 0.0038 | − − − | − 0.0064 | − − |
LILRB5 | 0.0106 | + + + + | − 0.0013 | − | − 0.006 | − − |
TLR4 | 0.0096 | + + + + | − 0.003 | − − | − 0.0046 | − |
CASP4 | 0.0065 | + + + | − 0.003 | − − | − 0.0021 | − |
CD59 | 0.0082 | + + + | − 0.0003 | − 0.0003 | ||
CLEC2L | 0.0063 | + + + | − 0.0044 | − − − | − 0.0102 | − − − |
CXCR1 | 0.0065 | + + + | − 0.0011 | − | − 0.0004 | |
EXOSC4 | 0.0081 | + + + | − 0.0018 | − | − 0.002 | − |
FAM188A | 0.0076 | + + + | − 0.0031 | − − | − 0.0049 | − |
IFNGR1 | 0.0066 | + + + | − 0.0002 | − 0.0017 | ||
IL17F | 0.0086 | + + + | − 0.0028 | − − | − 0.0043 | − |
IL1R2 | 0.0084 | + + + | − 0.0006 | − 0.0054 | − − | |
KLF2 | 0.0072 | + + + | 0.0018 | + | − 0.0025 | − |
KLF6 | 0.0064 | + + + | − 0.0008 | − | − 0.0022 | − |
MMP8 | 0.0068 | + + + | − 0.0006 | − 0.006 | − − | |
CLEC4F | 0.0039 | + + | − 0.0036 | − − | − 0.0065 | − − |
IFRD1 | 0.005 | + + | 0.0009 | + | − 0.0028 | − |
IL1RL1 | 0.0048 | + + | − 0.0032 | − − | − 0.0045 | − |
IL1RN | 0.0049 | + + | − 0.0028 | − − | − 0.0016 | |
MMP9 | 0.0057 | + + | 0.0004 | − 0.0042 | − | |
MOSPD2 | 0.0044 | + + | 0.0001 | − 0.0019 | − | |
TLR2 | 0.0059 | + + | − 0.0007 | − 0.0006 | ||
HIV_RNA | 0.0017 | + | − 0.0018 | − | − 0.0015 | |
IL1RL2 | 0.0032 | + | 0.0023 | + + | − 0.0011 | |
SIGLEC9 | 0.0023 | + | 0.003 | + + | 0.0038 | + |
IFNAR2 | 0.0008 | 0.0025 | + + | 0.0019 | + | |
NLRP3 | − 0.0009 | − | 0.0054 | + + + + | 0.0079 | + + |