Table 7 The plausible driver genes involved in the proposed main pathways related to MBCA
From: EARN: an ensemble machine learning algorithm to predict driver genes in metastatic breast cancer
PPDMB | KGCC | KGBC | CGMC | CGMB | Specific main pathways | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Chromatin organization | Circadian Clock | Organelle biogenesis and maintenance | Neuronal System | Metabolism | |||||
NCOR1 | 1 | 1 | #N/A | #N/A | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
HDAC3a | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
TBL1XR1 | 1 | 1 | 2 | #N/A | ✓ | ✓ | ✓ | ||
SIRT4 | 1 | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ||||
ABATa | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ||||
KRAS | 1 | 1 | 20 | #N/A | ✓ | ||||
GRIN1a | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ||||
PLCB1a | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ||||
CACNA1E | 1 | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ||||
PRKCG | 1 | #N/A | 1 | #N/A | ✓ | ||||
KPNA2a | #N/A | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ||||
GPS2 | 1 | 1 | #N/A | #N/A | ✓ | ✓ | |||
SIN3A | 1 | #N/A | #N/A | #N/A | ✓ | ||||
ACTB | 1 | #N/A | 1 | #N/A | ✓ | ||||
KDM6B | #N/A | #N/A | 1 | #N/A | ✓ | ||||
PRMT1 | #N/A | #N/A | 2 | #N/A | ✓ | ||||