First Author Last Name, Year | Outcome associated with SNP | Build | SNP IDs | Chr:Pos | Alleles | Minor Allele | Gene or Locus | MAF | N | Measure of Association type | Measure of Association value | Measure of Variability | Measure of Variability value | p value | Ethnicity | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Agrawal, 2011 | DSM-IV cannabis dependence | hg18 | rs1019238 | 17 |  |  | ANKFN1 | EA = 0.4, AA = 0.1 | 3054 | OR | 1.453 | 95% CI | 1.254–1.682 | 6.1E−07 | AA & EA | |||||||
rs1431318 | 17 |  |  | ANKFN1 | EA = 0.44, AA = 0.25 | 3054 | OR | 0.708 | 95% CI | 0.616–0.812 | 9.14E−07 | AA & EA | ||||||||||
Agrawal, 2014 | Cannabis use disorder factor scores from 12 DSM IV + 5 criteria | hg18 | rs4364205 | 3 |  | T |  | 0.41 | 1035 | β | − 0.19 | 95% CI | − 0.26−  (− 0.12) | 1.3E−07 | AA | |||||||
Demontis, 2019 | Cannabis use disorder | hg19 | rs56372821 | 8 | A/G | A |  | 0.163 | 51,372 | OR | 0.728 |  |  | 9.31E−12 | EA | |||||||
rs4732724 | 8 | C/G | C |  | 0.324 | 51,372 | OR | 0.82 |  |  | 1.34E−08 | EA | ||||||||||
rs6558008 | 8 | A/C | A |  | 0.755 | 51,372 | OR | 1.237 |  |  | 2.45E−08 | EA | ||||||||||
rs73229090 | 8 | A/C | A |  | 0.11 | 51,372 | OR | 0.702 |  |  | 7.41E−10 | EA | ||||||||||
rs937220 | 8 | A/G | A |  | 0.259 | 51,372 | OR | 0.8258 |  |  | 2.46E−07 | EA | ||||||||||
Minica, 2015 | Cannabis initiation | GRCh37 | rs35487050 | 19:35,221,228 | C/T |  | ZNF181 |  | 6744 | β | 0.81 | SE | 0.16 | 1.68E−07 | E | |||||||
rs35917943 | 19:35,147,183 | C/A |  |  |  < 0.05 | 6744 | β | 0.77 | SE | 0.15 | 1.62E−07 | E | ||||||||||
rs35760174 | 19:35,221,582 | C/G |  |  |  | 6744 | β | 0.76 | SE | 0.15 | 7.04E−07 | E | ||||||||||
Age of onset of cannabis use | rs142324060 | 5:95,425,757 | G/A |  |  |  < 0.05 | 5148 | β | 0.68 | SE | 0.11 | 7.66E−08 | E | |||||||||
rs78505392 | 5:95,422,966 | C/G |  |  |  | 5148 | β | 0.58 | SE | 0.1 | 2.16E−07 | E | ||||||||||
rs12003072 | 9:86,771,161 | A/C |  |  |  | 5148 | β | 0.52 | SE | 0.09 | 3.04E−07 | E | ||||||||||
rs77097806 | 5:95,456,735 | A/G |  |  |  | 5148 | β | 0.56 | SE | 0.1 | 3.54E−07 | E | ||||||||||
rs6879646 | 5:95,450,187 | A/G |  |  |  | 5148 | β | 0.57 | SE | 0.1 | 3.61E−07 | E | ||||||||||
rs4613744 | 5:95,451,494 | C/T |  |  |  | 5148 | β | 0.55 | SE | 0.1 | 5.07E−07 | E | ||||||||||
rs60218730 | 5:95,492,765 | G/T |  |  |  | 5148 | β | 0.59 | SE | 0.11 | 5.98E−07 | E | ||||||||||
rs74305417 | 9:86,779,774 | C/G |  |  |  | 5148 | β | 0.52 | SE | 0.09 | 6.2E−07 | E | ||||||||||
rs142981069 | 18:58,826,022 | G/A |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs12386084 | 18:58,827,145 | C/G |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs117918936 | 18:58,828,323 | G/A |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs2160801 | 18:58,829,024 | T/A |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs145424173 | 18:58,829,597 | T/C |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs117538409 | 18:58,830,942 | G/C |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs17817245 | 18:58,832,135 | A/G |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs140206809 | 18:58,833,215 | A/G |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs117692712 | 18:58,834,506 | T/G |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs17817423 | 18:58,835,462 | C/T |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs9916935 | 18:58,835,931 | T/C |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs192013604 | 18:58,838,324 | T/C |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs117471640 | 18:58,838,402 | A/G |  |  |  | 5148 | β | 0.47 | SE | 0.09 | 7.25E−07 | E | ||||||||||
rs78456402 | 9:86,781,900 | C/A |  |  |  | 5148 | β | 0.5 | SE | 0.09 | 9.09E−07 | E | ||||||||||
rs11998981 | 9:86,783,107 | T/C |  |  |  | 5148 | β | 0.5 | SE | 0.09 | 9.09E−07 | E | ||||||||||
rs79236058 | 5:95,478,830 | G/A |  |  |  | 5148 | β | 0.57 | SE | 0.1 | 9.59E−07 | E | ||||||||||
Pasman, 2018 | Lifetime cannabis use | hg19 | rs7609594 | 3:85,482,595 | G/A | A | CADM2 | 0.38 | 126,785 | β | 0.068 | SE | 0.01 | 5.86E−11 | E | |||||||
rs4099556 | 4:37,067,936 | G/A | A | MIR4801 | 0.176 | 126,785 | β | −0.079 | SE | 0.013 | 3.56E−09 | E | ||||||||||
rs78680891 | 3:51,028,954 | C/G | C |  | 0.002299 | 126,574 | β | − 0.52473 | SE | 0.106473 | 8.30E−07 | E | ||||||||||
rs2071704 | 4:3,240,159 | C/T | C |  | 0.419929 | 125,953 | β | − 0.04974 | SE | 0.010162 | 9.83E−07 | E | ||||||||||
rs76565656 | 7:148,048,453 | G/A | G |  | 0.122539 | 124,918 | β | − 0.07974 | SE | 0.015258 | 1.73E−07 | E | ||||||||||
rs4308708 | 8:76,702,058 | A/C | A |  | 0.041699 | 126,193 | β | − 0.13628 | SE | 0.025107 | 5.70E−08 | E | ||||||||||
rs10883796 | 10:104,655,315 | G/A | G |  | 0.296441 | 126,444 | β | − 0.05638 | SE | 0.010951 | 2.62E−07 | E | ||||||||||
rs11186071 | 10:91,969,337 | G/A | G |  | 0.004168 | 126,711 | β | − 0.90907 | SE | 0.18524 | 9.22E−07 | E | ||||||||||
rs11214441 | 11:112,846,713 | T/A | T |  | 0.394257 | 126,761 | β | − 0.05354 | SE | 0.010263 | 1.82E−07 | E | ||||||||||
rs5442 | 12:6,954,864 | G/A | G |  | 0.066921 | 126,785 | β | − 0.09622 | SE | 0.019181 | 5.27E−07 | E | ||||||||||
rs75448266 | 12:6,798,632 | A/C | A |  | 0.084049 | 125,672 | β | − 0.0944 | SE | 0.017746 | 1.04E−07 | E | ||||||||||
rs17083392 | 13:69,026,559 | A/G | A |  | 0.004286 | 126,745 | β | − 1.60924 | SE | 0.3177 | 4.08E−07 | E | ||||||||||
rs2019135 | 13:69,034,323 | T/C | T |  | 0.004267 | 126,772 | β | − 1.76061 | SE | 0.323766 | 5.39E−08 | E | ||||||||||
rs2019150 | 13:69,034,188 | C/A | C |  | 0.004262 | 126,771 | β | − 1.76061 | SE | 0.323766 | 5.39E−08 | E | ||||||||||
rs677755 | 13:69,041,438 | T/C | T |  | 0.00486 | 126,760 | β | 1.426 | SE | 0.290601 | 9.24E−07 | E | ||||||||||
rs74632168 | 13:69,048,954 | C/T | C |  | 0.004056 | 126,772 | β | − 1.72062 | SE | 0.319014 | 6.91E−08 | E | ||||||||||
rs2650494 | 16:28,318,440 | A/G | A |  | 0.414312 | 124,286 | β | − 0.05259 | SE | 0.010223 | 2.68E−07 | E | ||||||||||
rs325363 | 18:38,331,295 | G/A | G |  | 0.229965 | 126,624 | β | 0.059212 | SE | 0.011689 | 4.07E−07 | E | ||||||||||
rs4492854 | 11:112,983,534 | C/T | C |  | 0.4363 | 30,366 | β | 0.1113 | SE | 0.021251 | 1.63E−07 | E | ||||||||||
Sherva, 2016 | DSM-IV cannabis dependence criteria count | GRCh37 | - | 1:212,183,114:I |  |  | INTS7 |  | 1250 |  |  |  |  | 2.05E−07 | AA | |||||||
rs141482228 |  |  |  | INTS7 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.84E−10 | AA | ||||||||||
rs77349458 |  |  |  | SNORA26,INTS7 |  | 1250 |  |  |  |  | 1.57E−07 | AA | ||||||||||
rs77448142 |  |  |  | RPS20P10,RPS20P10-CYP26B1 |  | 1250 |  |  |  |  | 2.13E−07 | AA | ||||||||||
- | 2:167,239,818:D |  |  | SCN9A-SCN7A |  | 4750 |  |  |  |  | 7.43E−07 | AA | ||||||||||
rs313542 |  |  |  | PI4K2B |  | 2640 |  |  |  |  | 7.12E−10 | EA | ||||||||||
rs7689780 |  |  |  | PI4K2B,PI4K2B-ZCCHC4 |  | 2640 |  |  |  |  | 4.63E−07 | EA | ||||||||||
rs73323306 |  |  |  | ARL2BPP5-RP11-541P9.3 |  | 4750 |  |  |  |  | 7.61E−09 | AA | ||||||||||
rs7832545 |  |  |  | CSMD1 |  | 2640 |  |  |  |  | 3.61E−10 | EA | ||||||||||
3.02E−07* | ||||||||||||||||||||||
rs77378271 |  |  |  | CSMD1 |  | 2640 |  |  |  |  | 5.30E−10 | EA | ||||||||||
6.69E−07* | ||||||||||||||||||||||
rs75721860 |  |  |  | CSMD1 |  | 2640 |  |  |  |  | 2.75E−09 | EA | ||||||||||
rs7853028 |  |  |  | PSMB7 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.94E−09 | AA | ||||||||||
rs4643011 |  |  |  | HABP2 |  | 1250 |  |  |  |  | 7.21E−07 | AA | ||||||||||
rs116474042 |  |  |  | RP11-755E23.3-CCDC67 |  | 4750 |  |  |  |  | 3.81E−07 | AA | ||||||||||
rs189167038 |  |  |  | SNORD11-RNU6-1014P |  | 1250 |  |  |  |  | 2.64E−09 | AA | ||||||||||
rs142162415 |  |  |  | SNORD11-RNU6-1014P |  | 1250 |  |  |  |  | 1.88E−08 | AA | ||||||||||
rs117047810 |  |  |  | SNORD11-RNU6-1014P |  | 1250 |  |  |  |  | 5.68E−08 | AA | ||||||||||
rs11466037 |  |  |  | MEFV |  | 1250 |  |  |  |  | 8.08E−07 | AA | ||||||||||
rs183568578 |  |  |  | MEFV |  | 1250 |  |  |  |  | 5.62E−07 | AA | ||||||||||
rs114269992 |  |  |  | RP5-860P4.2-CST7 |  | 1250 |  |  |  |  | 2.13E−07 | AA | ||||||||||
1.63E−07* | ||||||||||||||||||||||
rs114620529 |  |  |  | RP5-860P4.2-CST7 |  | 1250 |  |  |  |  | 2.15E−07 1.61E−07 | AA | ||||||||||
rs116629084 |  |  |  | RP5-860P4.2-CST7 |  | 1250 |  |  |  |  | 1.70E−07 | AA | ||||||||||
1.27E−07* | ||||||||||||||||||||||
rs115384512 |  |  |  | RP5-860P4.2-CST7 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.91E−08 | AA | ||||||||||
7.19E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs147641662 |  |  |  | CST7,RP5-860P4.2-CST7 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.87E−08 | AA | ||||||||||
7.13E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs191783144 |  |  |  | CST7,RP5-860P4.2-CST7 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.81E−08 | AA | ||||||||||
7.07E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs146806338 |  |  |  | CST7,RP5-860P4.2-CST7 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.80E−08 | AA | ||||||||||
7.03E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs114828727 |  |  |  | CST7,APMAP,CST7-APMAP |  | 1250 |  |  |  |  | 9.01E−08 | AA | ||||||||||
6.92E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs114128002 |  |  |  | APMAP |  | 1250 |  |  |  |  | 8.06E−08 | AA | ||||||||||
6.33E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs115342711 |  |  |  | RNU6-1257P,APMAP |  | 1250 |  |  |  |  | 2.54E−07 | AA | ||||||||||
1.15E−07* | ||||||||||||||||||||||
- | 20:24,955,422:I |  |  | RNU6-1257P,APMAP |  | 1250 |  |  |  |  | 2.54E−07 | AA | ||||||||||
1.15E−07* | ||||||||||||||||||||||
rs115764440 |  |  |  | APMAP |  | 1250 |  |  |  |  | 2.33E−07 | AA | ||||||||||
9.03E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs116068335 |  |  |  | APMAP-ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 1.66E−07 | AA | ||||||||||
5.62E−08* | ||||||||||||||||||||||
rs114637142 |  |  |  | ACSS1,APMAP-ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 9.15E−08 | AA | ||||||||||
rs114071901 |  |  |  | ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 1.06E−07 | AA | ||||||||||
rs113232742 |  |  |  | ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.82E−08 | AA | ||||||||||
rs114199928 |  |  |  | ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.42E−08 | AA | ||||||||||
rs114836364 |  |  |  | ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 8.23E−08 | AA | ||||||||||
rs116669368 |  |  |  | ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 5.08E−08 | AA | ||||||||||
rs145379934 |  |  |  | ACSS1 |  | 1250 |  |  |  |  | 3.96E−08 | AA | ||||||||||
rs143020225 | 2:167,214,714 | G/A | G | snoU13,SCN9A | 0.95 | 4750 |  |  |  |  | 5.85E−07 | AA | ||||||||||
- | chr22:26,917,069:I |  |  | C9.15,TPST2,CTA-445C9.14-CTA-4 |  | 2640 |  |  |  |  | 3.15E−10 | EA | ||||||||||
rs4149485 |  |  |  | TPST2,CTA-445C9.15 |  | 2640 |  |  |  |  | 2.24E−10 | EA |