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Table 2 Differentially expressed miRNAs in Huntington’s disease prefrontal cortex

From: miR-10b-5p expression in Huntington’s disease brain relates to age of onset and the extent of striatal involvement

miRNA Average expression Original study, N=21 Replication study, N=41 Combined study, N=64
logFC p-value FDR q-value logFC p-value FDR q-value logFC p-value FDR q-value
miR-10b-5p 11.62 4.31 4.56E-11 4.28E-08 3.40 4.30E-12 1.35E-09 3.94 1.28E-20 1.20E-17
miR-196a-5p 2.41 2.18 1.66E-09 7.80E-07 2.13 3.42E-12 1.35E-09 2.35 2.97E-20 1.39E-17
miR-615-3p 1.95 1.28 1.69E-06 3.97E-04 1.73 2.56E-13 2.40E-10 1.59 2.33E-16 7.28E-14
miR-10b-3p 2.02 1.37 4.64E-07 1.45E-04 1.15 2.93E-06 6.88E-04 1.45 2.13E-12 4.98E-10
miR-1298-3p 7.05 −0.56 1.72E-03 9.47E-02 −0.80 1.09E-05 2.04E-03 −0.78 5.52E-09 1.03E-06
miR-196b-5p 2.56 1.05 7.62E-05 1.02E-02 1.06 9.34E-04 5.84E-02 1.31 2.33E-08 3.64E-06
miR-302a-3p 2.28 0.64 6.22E-03 1.94E-01 0.84 3.57E-04 2.79E-02 0.81 3.72E-06 4.98E-04
miR-1247-5p 6.18 0.90 2.05E-05 3.84E-03 0.46 7.81E-03 1.63E-01 0.62 8.47E-06 9.55E-04
miR-144-3p 10.26 0.80 4.48E-02 3.73E-01 1.09 2.63E-04 2.47E-02 1.08 9.16E-06 9.55E-04
miR-223-3p 8.46 0.49 3.95E-02 3.54E-01 0.94 6.20E-05 7.33E-03 0.75 1.94E-05 1.82E-03
miR-3200-3p 9.75 −0.25 8.48E-02 4.65E-01 −0.29 4.20E-03 1.31E-01 −0.32 4.85E-05 4.14E-03
miR-302a-5p 2.99 0.52 2.86E-03 1.28E-01 0.62 1.97E-02 2.66E-01 0.70 5.70E-05 4.46E-03
miR-1264 5.00 −0.24 1.09E-01 5.15E-01 −0.69 3.87E-04 2.79E-02 −0.53 9.49E-05 6.36E-03
miR-6734-5p 2.79 −0.34 1.89E-01 6.19E-01 −1.16 1.63E-05 2.55E-03 −0.79 8.86E-05 6.36E-03
miR-144-5p 9.30 0.51 1.43E-01 5.71E-01 1.13 3.31E-04 2.79E-02 0.94 1.04E-04 6.53E-03
miR-138-2-3p 6.08 −0.44 3.59E-03 1.41E-01 −0.29 3.24E-02 3.01E-01 −0.38 1.43E-04 8.38E-03
miR-431-5p 5.65 −0.49 2.33E-02 3.09E-01 −0.51 7.64E-03 1.63E-01 −0.57 1.60E-04 8.84E-03
miR-132-3p 12.93 −0.48 1.57E-02 2.60E-01 −0.43 2.72E-02 2.89E-01 −0.54 1.99E-04 9.31E-03
miR-200c-3p 3.84 0.46 3.97E-02 3.54E-01 0.26 1.12E-01 4.84E-01 0.48 1.97E-04 9.31E-03
miR-23b-5p 3.18 −0.30 8.92E-02 4.66E-01 −0.62 2.02E-03 9.46E-02 −0.55 1.81E-04 9.31E-03
miR-448 4.02 −0.14 5.66E-01 8.91E-01 −0.80 9.98E-05 1.04E-02 −0.64 2.23E-04 9.96E-03
miR-486-3p 4.84 0.54 7.85E-02 4.57E-01 0.79 4.16E-03 1.31E-01 0.78 2.76E-04 1.04E-02
miR-490-5p 5.56 −0.45 6.53E-02 4.34E-01 −0.56 1.15E-02 2.12E-01 −0.62 2.62E-04 1.04E-02
miR-5695 3.30 0.38 3.04E-02 3.28E-01 0.48 4.02E-03 1.31E-01 0.47 2.73E-04 1.04E-02
miR-885-5p 10.46 −0.31 5.23E-02 4.07E-01 −0.27 3.12E-02 3.01E-01 −0.35 2.77E-04 1.04E-02
miR-1224-5p 8.08 −0.39 3.89E-02 3.54E-01 −0.53 4.83E-03 1.39E-01 −0.49 3.83E-04 1.20E-02
miR-1298-5p 6.43 −0.80 9.80E-03 2.17E-01 −0.65 3.24E-02 3.01E-01 −0.81 3.84E-04 1.20E-02
miR-142-3p 8.13 0.20 3.09E-01 7.41E-01 0.62 1.70E-03 8.39E-02 0.52 3.84E-04 1.20E-02
miR-346 8.21 −0.31 6.05E-02 4.26E-01 −0.27 1.74E-02 2.66E-01 −0.32 3.71E-04 1.20E-02
miR-891a-5p 5.84 0.79 5.16E-05 8.07E-03 0.18 3.68E-01 7.04E-01 0.50 3.69E-04 1.20E-02
miR-16-2-3p 7.23 0.30 3.45E-01 7.53E-01 0.83 6.97E-04 4.67E-02 0.71 3.98E-04 1.21E-02
miR-363-3p 11.07 0.39 1.08E-02 2.20E-01 0.30 2.71E-02 2.89E-01 0.34 4.14E-04 1.21E-02
miR-148a-3p 13.01 0.69 1.70E-02 2.60E-01 0.47 7.34E-02 4.18E-01 0.69 4.57E-04 1.29E-02
miR-199a-5p 7.66 0.69 3.46E-02 3.35E-01 0.66 4.30E-02 3.45E-01 0.82 4.66E-04 1.29E-02
miR-4449 3.25 −0.96 1.83E-03 9.51E-02 −0.86 5.21E-02 3.68E-01 −1.09 5.28E-04 1.42E-02
miR-106a-5p 6.28 0.52 9.97E-03 2.17E-01 0.40 3.15E-02 3.01E-01 0.44 5.64E-04 1.43E-02
miR-142-5p 11.47 0.20 4.43E-01 8.36E-01 0.71 1.66E-03 8.39E-02 0.60 5.77E-04 1.43E-02
miR-549a 3.25 0.57 9.95E-02 4.89E-01 0.86 1.84E-02 2.66E-01 0.95 5.67E-04 1.43E-02
miR-214-5p 3.99 0.81 8.21E-03 2.12E-01 0.42 2.23E-01 5.96E-01 0.84 6.62E-04 1.59E-02
miR-141-3p 5.43 0.48 1.12E-01 5.20E-01 0.34 2.00E-02 2.66E-01 0.47 8.05E-04 1.89E-02
miR-5680 5.39 −0.20 1.92E-01 6.23E-01 −0.41 5.42E-03 1.40E-01 −0.35 9.93E-04 2.27E-02
miR-3065-5p 6.04 0.37 1.10E-01 5.15E-01 0.40 6.86E-03 1.57E-01 0.42 1.04E-03 2.33E-02
miR-224-5p 4.95 0.71 5.90E-02 4.20E-01 0.82 1.98E-02 2.66E-01 0.88 1.19E-03 2.60E-02
miR-4787-3p 5.94 −0.25 1.84E-01 6.15E-01 −0.30 1.29E-02 2.23E-01 −0.33 1.23E-03 2.62E-02
miR-452-5p 4.76 0.32 2.06E-01 6.41E-01 0.68 2.02E-02 2.66E-01 0.67 1.29E-03 2.69E-02
miR-129-1-3p 9.79 −0.42 3.13E-02 3.33E-01 −0.28 5.47E-02 3.79E-01 −0.38 1.36E-03 2.76E-02
miR-4443 5.69 0.92 1.10E-02 2.20E-01 0.41 1.54E-01 5.39E-01 0.75 1.39E-03 2.77E-02
miR-101-5p 9.55 0.30 2.49E-02 3.11E-01 0.20 1.08E-01 4.74E-01 0.28 1.47E-03 2.88E-02
miR-483-5p 4.39 1.03 5.31E-02 4.07E-01 0.78 8.24E-02 4.31E-01 1.16 1.52E-03 2.91E-02
miR-2114-5p 3.41 0.39 3.34E-02 3.33E-01 0.29 1.85E-01 5.72E-01 0.48 1.65E-03 3.09E-02
miR-1185-1-3p 5.32 −0.24 2.34E-01 6.71E-01 −0.43 8.49E-03 1.67E-01 −0.41 1.70E-03 3.12E-02
miR-670-3p 6.70 −0.46 5.50E-02 4.13E-01 −0.39 7.24E-02 4.18E-01 −0.52 1.77E-03 3.19E-02
miR-129-5p 12.39 −0.13 3.31E-01 7.47E-01 −0.50 3.31E-03 1.20E-01 −0.35 1.95E-03 3.22E-02
miR-135b-5p 4.45 −0.49 1.70E-02 2.60E-01 −0.44 5.58E-02 3.82E-01 −0.52 1.97E-03 3.22E-02
miR-194-5p 8.77 0.23 8.25E-02 4.64E-01 0.32 3.68E-02 3.29E-01 0.33 1.99E-03 3.22E-02
miR-208b-3p 6.41 0.46 1.10E-02 2.20E-01 0.28 7.05E-02 4.18E-01 0.36 1.89E-03 3.22E-02
miR-4488 2.97 −1.38 3.79E-04 3.24E-02 −0.91 1.35E-01 5.16E-01 −1.32 1.96E-03 3.22E-02
miR-888-5p 2.83 0.56 3.39E-02 3.35E-01 0.39 7.20E-02 4.18E-01 0.56 1.91E-03 3.22E-02
miR-126-5p 15.88 0.41 2.59E-02 3.16E-01 0.23 6.10E-02 4.03E-01 0.29 2.46E-03 3.88E-02
miR-34c-5p 9.25 −1.09 6.77E-04 4.75E-02 −0.40 1.41E-01 5.26E-01 −0.64 2.48E-03 3.88E-02
miR-218-1-3p 6.08 0.30 5.80E-02 4.20E-01 0.39 2.29E-02 2.76E-01 0.35 2.53E-03 3.89E-02
miR-150-5p 10.20 0.42 2.03E-02 2.84E-01 0.33 6.04E-02 4.02E-01 0.39 2.74E-03 4.11E-02
miR-486-5p 14.08 0.70 7.24E-02 4.52E-01 0.66 4.08E-02 3.39E-01 0.75 2.76E-03 4.11E-02
miR-433-3p 10.55 −0.01 9.48E-01 9.91E-01 −0.36 1.23E-03 7.24E-02 −0.24 2.85E-03 4.18E-02
miR-219b-3p 3.11 −0.46 1.89E-02 2.78E-01 −0.24 3.09E-01 6.46E-01 −0.47 3.05E-03 4.40E-02
miR-548n 2.82 0.09 6.44E-01 9.27E-01 0.64 6.41E-03 1.50E-01 0.52 3.14E-03 4.46E-02
miR-663b 2.20 −0.73 1.49E-02 2.59E-01 −0.59 9.97E-02 4.58E-01 −0.81 3.21E-03 4.50E-02
miR-148a-5p 6.67 0.46 4.67E-02 3.81E-01 0.44 7.58E-02 4.18E-01 0.52 3.31E-03 4.57E-02
miR-29a-3p 15.37 0.20 1.33E-01 5.56E-01 0.22 4.17E-02 3.40E-01 0.23 3.46E-03 4.70E-02
miR-320b 5.63 1.13 1.69E-02 2.60E-01 0.56 1.93E-01 5.78E-01 0.97 3.54E-03 4.74E-02
miR-181a-3p 12.15 −0.43 2.97E-02 3.26E-01 −0.29 9.44E-02 4.51E-01 −0.38 3.60E-03 4.75E-02
miR-153-5p 7.32 0.55 7.08E-03 2.05E-01 0.22 1.80E-01 5.72E-01 0.37 3.78E-03 4.79E-02
miR-28-5p 10.13 0.24 1.37E-01 5.65E-01 0.22 6.84E-02 4.14E-01 0.27 3.75E-03 4.79E-02
miR-7-2-3p 6.06 0.25 8.90E-02 4.66E-01 0.26 4.67E-02 3.59E-01 0.27 3.78E-03 4.79E-02
miR-877-5p 7.14 −0.28 1.28E-01 5.50E-01 −0.29 2.07E-02 2.66E-01 −0.28 3.88E-03 4.85E-02
miR-3687 4.14 −1.37 3.47E-04 3.24E-02 −0.77 1.96E-01 5.78E-01 −1.20 4.25E-03 5.17E-02
miR-4516 3.82 −1.29 3.03E-04 3.16E-02 −0.77 1.72E-01 5.61E-01 −1.13 4.42E-03 5.24E-02
miR-3139 3.01 −0.82 4.64E-04 3.63E-02 0.00 9.86E-01 9.94E-01 −0.48 9.64E-03 8.37E-02
miR-663a 2.56 −1.02 1.61E-04 1.89E-02 −0.46 3.60E-01 6.98E-01 −0.86 1.40E-02 1.04E-01
miR-34b-3p 5.11 −0.92 7.09E-04 4.75E-02 −0.24 3.87E-01 7.16E-01 −0.49 1.77E-02 1.20E-01
miR-1538 2.63 0.20 3.04E-01 7.41E-01 −0.70 6.26E-05 7.33E-03 −0.21 1.30E-01 3.68E-01