Skip to main content

Table 4 Distribution of rare and deleterious variants on four Joubert Syndrome genes from GHR in 13 cases with ritodrine-induced serious cardiac and pulmonary side effects

From: Deleterious genetic variants in ciliopathy genes increase risk of ritodrine-induced cardiac and pulmonary side effects

Gene Symbol

rsID

Variant deleteriousness score

MAF

SN1275

SN1923

SN2931

SN2956

SN3230

SN3828

SN4181

SN4211

SN4407

SN5021

SN5209

SN8592

SN9899

SIFT

CADD

PolyPhen2

AHI1

rs148000791

0.25

23.6

NA

0.0077

HET

WT

HET

HET

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

HET

WT

ARL13B

rs193219215

0.12

20.9

0.41

0.0008

WT

WT

WT

WT

HET

WT

WT

WT

WT

WT

WT

HET

WT

KIF7

rs546772749

0.01

9.2

0.01

0.0002

HET

WT

HET

HET

HET

WT

WT

WT

HET

HET

WT

WT

WT

 

rs536773143

0.16

15.4

0.89

0.0002

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

HET

WT

RPGRIP1L

rs146925098

0

19.7

0.99

0.0002

WT

WT

WT

WT

HET

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

WT

  1. SIFT Sorting Intolerant from Tolerant, CADD Combined Annotation Dependent Depletion, PolyPhen2 Polymorphism Phenotyping v2.2.2, AF allele frequency, HET heterozygous, WT wild type, AHI1 Abelson Helper Integration Site 1, ARL13B ADP Ribosylation Factor Like GTPase 13B, KIF7 Kinesin Family Member 7, RPGRIP1L RPGRIP1 Like